城市在回复复兴平静后,大反派重新召集旧部卷土重来,并勾搭外星恶势力朗格试图称霸地球,忍者神龟莱昂纳多(
皮特·普劳泽克 Pete Ploszek 饰)、拉斐尔(
阿兰·里奇森 Alan Ritchson 饰)、多纳泰罗(
杰瑞米·霍华德 Jeremy Howard 饰)和米爽朗基罗(
诺尔·费舍 Noel Fisher 饰)与女记者艾蓓丽尔·奥尼尔(
梅根·福克斯 Megan Fox 饰)、韦恩·芬威克(
威尔·阿奈特 Will Arnett 饰),及面具义警凯西·琼斯(
斯蒂芬·阿梅尔 Stephen Amell 饰)并肩作战袭击恶徒。在史莱德(
布莱恩·泰 Brian Tee 饰)逃脱扣押后,他与猖獗的科学家巴克斯特斯·托克曼(
泰勒·派瑞 Tyler Perry 饰)及其两个笨拙的左膀右臂猪面和牛头结合,发布了一个操作世界的恶魔设计。在神龟们与史莱德及其同伙对抗的同时,他们发觉自身正面临着一个更险恶的力气大反派格朗,神龟们面对的将是宇宙级的强大对手。