故事发生在二十一世纪初始，日本依旧笼盖在德川幕府的统治之下，柳生宗朗（平川大辅 配音）家中世代经营道场，宗朗自己则肩负着成为下任当家的深重义务。尽管身为德川家康的臣子，但宗朗对幕府的独裁以及武应学园塾对于抗击学生的暴力弹压感到非常不满。他的不满导致了飞来横祸，不仅道场面临关门大吉的运气，宗朗更是受到了学生会派出的精锐军队的追杀。 就在命悬一线之时，一位名为柳生十兵卫（
悠木碧 配音）的红发少女骤然从天而降击退了敌方，之后，柳生义仙（水原薰 配音）、真田幸村（
钉宫理惠 配音）、后藤又兵卫（小林优 配音）等一干武江少女三番五次的显如今了宗朗的身边。
